ความซ้ำซ้อนของระบบภูมิคุ้มกันเกิดจากความสามารถของส่วนประกอบต่างๆ ในการปกป้องร่างกาย ส่วนประกอบของระบบภูมิคุ้มกันส่วนใหญ่สามารถแยกแยะความแตกต่างเพื่อให้บรรลุหน้าที่เฉพาะเจาะจงมากขึ้น หรือส่งสัญญาณไปยังองค์ประกอบอื่นๆ ไมโครไบโอม เพื่อผลิตการตอบสนองของภูมิคุ้มกันโดยรวม การทำงานของระบบภูมิคุ้มกันที่ผันแปรเหล่านี้ โดยเฉพาะระบบภูมิคุ้มกันโดยธรรมชาติและภูมิคุ้มกันที่ปรับตัวได้ จะซ้อนทับกันเพื่อให้ภูมิคุ้มกันทั่วไปแก่ร่างกาย