แม้ว่าจะพบได้น้อยมาก แต่ก็มีรายงานการปนเปื้อนของ clostridium botulinum บ้าง ซึ่งมักเกิดขึ้นเมื่อกระบวนการบรรจุกระป๋องเป็นความผิดพลาด และมีแนวโน้มมากขึ้นเมื่อผู้บริโภคสามารถผลิตผลิตภัณฑ์ของตนเองที่บ้านได้ อย่างไรก็ตามในการเลือกซื้อผลิตภัณฑ์กระป๋องควรหลีกเลี่ยงกระป๋องที่มีรอยบุบ ผลไม้กระป๋อง นูน หรือรั่ว ผลิตผลกระป๋องบางชนิดอาจเติมเกลือหรือน้ำตาลเพื่อปรับปรุงรสชาติ เนื้อสัมผัส หรือรูปลักษณ์ ผู้ที่รับประทานอาหารที่มีเกลือต่ำหรือควบคุมปริมาณน้ำตาลควรตรวจสอบฉลากและมองหาผลิตภัณฑ์ที่ไม่มีส่วนผสมเพิ่มเติม เมื่อเลือกผลไม้กระป๋อง ให้เลือกตัวเลือกกระป๋องในน้ำผลไม้ธรรมชาติแทนน้ำเชื่อม เมื่อเปิดกระป๋องแล้ว การสะเด็ดน้ำและล้างกระป๋องอาจช่วยลดปริมาณน้ำตาลและเกลือได้